五岁男孩身高标准一般是110cm，如果是100cm，是低于平均值的，可能是矮小症，但是身高与许多原因有关，如遗传、营养、外界环境等，具体情况需要具体分析。
首先，要注意孩子父母的身高是否对孩子有影响，预测孩子最终身高。另外，孩子要注意均衡饮食，不挑食，补充维生素以及微量元素，不吃零食、不喝饮料，孩子要多参加户外活动、多晒太阳、多运动，有利于身高长高。
五岁男孩如果是100cm，建议尽快就诊，做相关的检查，明确诊断，必要的时候积极的予以干预治疗。