慢性化脓性骨髓炎治疗方法如下：
第一、病灶清除术，切除窦道，摘除死骨，刮除肉芽，伤口内留置凡士林纱布，隔日换药一次，直至伤口愈合；
第二、肌瓣嵌塞术，于摘除死骨后腔洞内置以有血运的羁肌瓣及抗生素后缝合伤口，较常用于股骨及肱骨；
第三、骨部分切除术，在累及某些不影响功能的骨骼时可切除病灶骨骼，适用于肋骨、腓骨及髂骨翼等；
第四、截指术，在有癌变时应做截指术，对不重要的足趾及手指，为挽救其他手指及足趾功能，可做截指术。慢性骨髓炎治疗原则是彻底摘除死骨、消灭死腔、切除硬化的窦道。