在临床当中，先天性蛛网膜囊肿的治疗一般选取的是保守的方式进行，有时也选择手术治疗，具体如下：
1、保守治疗：先天性蛛网膜囊肿很多情况下，长的并不大，对大脑的压迫也并不是十分强烈，很多都是在无意当中发现，主要是保守观察。偶尔可能会口服相关药物进行改善，如果头痛的话，可以口服酮咯酸氨丁三醇胶囊，头晕的话，可以口服倍他司汀。
2、手术治疗：在随访观察期间，注意患者的相关症状的变化，如果产生越来越重的临床症状，并且蛛网膜囊肿经过相关检查之后，发现越来越大，严重压迫脑组织，要进行外科手术，比如穿刺引流手术或者是进行开颅蛛网膜囊肿清除手术等等。
所以要结合实际，才能更好评判。