生殖器疱疹的传染源是生殖器单纯疱疹病毒感染者，一般现症病人的传染性比较强。但有一些患者症状不典型，危险性更大。还有一些人处于亚临床感染或者无症状的状态，这种人也有可能会排毒，也具有传染性。传播途径主要是由水平传播和垂直传播两种。水平传播是指性接触传播，这种方式包括生殖器性交、口生殖器性交和肛门性交。垂直传播是指的母婴传播,母亲和胎儿间的传播，包括子宫内感染和经产道感染。由于这种病毒在室温和干燥条件下很容易灭活，所以经过唾液传播和污染物间接传播比较罕见。当性交和身体接触的时候，带毒方的病毒可以直接接种于包皮、龟头、宫颈、外阴、肛门和口咽黏膜表面，也可以通过生殖器和肛门皮肤黏膜摩擦后出现的微小裂隙及损伤处进入对方的皮肤黏膜。