神经官能症的发生与很多因素有关，主要分为家庭、社会心理因素和生物学因素，其中不良的社会心理是神经官能症发病的基本条件。
一、主要病因
1、家庭因素：童年期创伤、家庭暴力、父母的受教育程度较低均为不良家庭因素影响，。
2、社会心理因素：包括性别、年龄、种族、婚姻状况、经济状况、社会地位、工作状况、受教育水平、应激事件、个性特征、防御方式、战争、社会支持，与本病的发病有较密切的联系。
3、生物学因素：如遗传因素、神经内分泌因素、神经生化因素等，不健康的素质和人格特性常构成发病的基础，但其症状没有可证实的器质性疾病作为基础。
二、诱发因素
1、脑部损伤：曾经患过脑炎、癫痫、脑外伤等，可能导致大脑高级神经和自主神经功能失调，从而诱发神经官能症。
2、生活事件、精神应激事件：发病前往往遭受较多负性生活事件，这些事件多具有不可预期、不可控制、不符合主观愿望的特点，容易造成严重的精神刺激，导致发病。