自身免疫性疾病泛指影响骨关节肌肉及其周围软组织，如肌腱、筋膜、滑膜、血管等一大组疾病。常见的系统性结缔组织病有干燥综合征、系统性红斑狼疮、皮肌炎、多肌炎、硬皮病等，该类疾病大多有自身抗体，可以导致全身多脏器损伤，病情较重，如不及时治疗，预后较差。此外，还有关节炎，常见的有类风湿关节炎、骨关节炎、脊柱关节炎等。该类疾病大多通过正规治疗后，病情可得到有效控制，少数患者可以出现关节破坏而致残。