小脑梗死后遗症的治疗要经过系统康复治疗，患者如果在小脑梗死急性期过后，仍然有言语的含糊不清，或者爆破样、饮食样的小脑语言，头晕，肢体活动不灵活等症状，超过半年没有完全的恢复，就可以诊断为小脑梗死的后遗症。
治疗就要康复科进行系统的、积极的、正确的功能锻炼，改善患者的症状，因为正确的功能锻炼可以帮助患者头晕症状得到恢复，也对语音方面有一定的缓解，但是患者因为小脑梗死以后会有走路时宽基底的步态，患者也会有一定程度的头晕。积极进行心理方面的干预和治疗，避免患者因为小脑梗死后出现情绪上的障碍，有焦虑症、抑郁症的发生。