3个月宝宝拉肚子主要见于非感染性腹泻，有可能跟天气过凉、过热以及喂养不当关系最大。其次才是感染性腹泻，如果天气过凉，造成肠蠕动过快，孩子就容易拉水样大便或绿色大便，天气过热时消化酶分泌少，也容易造成消化不良。
通常建议先化验大便，排除感染性的因素，母乳喂养的小宝宝一定要注意妈妈的饮食，不要暴饮暴食，尤其天气热，妈妈容易上火，这时候要适当的清淡饮食，多喝水，不能吃油腻、刺激性、凉的食物。给孩子可以吃益生菌调节，奶粉喂养的宝宝要适当的多喝水。
腹泻如果病程超过1周以上，建议换成腹泻奶粉，如果腹泻1周缓解了，缓解1周以上建议从腹泻奶粉换成正常奶粉，要慢慢的转奶，不能一下子就转过来。