非淋菌性尿道炎的临床症状包括尿路的刺激症状，如尿频、尿急、尿痛，或者可以出现尿道稀薄、白色的分泌物，严重时也可以引起血尿或者下腹坠胀、疼痛不适等临床表现。
大多数非淋菌性尿道炎通常跟细菌或者支原体、衣原体等微生物具有一定的联系，可以完善尿液常规、尿细菌培养及药敏结果，根据药敏结果选择适宜的抗生素，选用的抗生素主要包括喹诺酮类、头孢类、青霉素类或者大环内酯类阿奇霉素等相应的药物。