恩替卡韦可以治疗慢性乙肝和乙肝引起的肝硬化，但不能根治乙肝。恩替卡韦属于核苷类似物，主要通过抑制乙肝病毒DNA聚合酶，来达到抑制乙肝病毒复制的目的。可以抑制乙肝病毒达到HBV-DNA阴转、保持病情稳定、肝生化正常、阻止病毒的进展。但因为仅能抑制病毒复制，不能够从体内彻底清除乙肝病毒，所以不能根治乙肝。
应用恩替卡韦治疗之后，患者病情稳定、不进展，但如果已经发展到肝硬化再来就诊，早期肝硬化还有可能逆转。但如果已经进入到失代偿期的肝硬化，即使病毒得到控制，但也很难逆转回去。应用恩替卡韦不能够随便停药，停药后可以导致病情的反弹，需要定期到医院复诊，进行肝病的相关检查。患者可以出现恩替卡韦的耐药，一旦出现耐药，HBV-DNA可以复阳，患者可以出现肝损伤，所以需要定期检查，出现耐药之后需要及时更换治疗方案。