卵巢囊肿发生的原因不清楚，为什么会发生卵巢囊肿？医学上的原因尚述不清。卵巢囊肿分为良性、交界性和恶性，如果是良性囊肿，体积在5cm以下，大部分不需要特殊治疗，只需要观察就可以。如果是良性囊肿，体积>5cm，建议腹腔镜下行卵巢囊肿剔除术。
如果是交界性肿物，建议做一侧附件切除。如果是恶性肿物，根据卵巢囊肿的特性和恶性肿物的期别，做相应的治疗，建议选择以手术治疗为主，以放化疗为辅的治疗方案。所以，卵巢囊肿形成的原因不是很清楚，在病因学上是原因不清的一种疾病。