真菌感染可以分为表浅真菌感染和深部真菌感染两类，常用的抗真菌药物按照作用的部位，也可以分为治疗浅表性的真菌药物和治疗深部真菌的药物。
治疗浅表性真菌感染的药物有十一烯酸、醋酸、乳酸、水杨酸、灰黄霉素、克念菌素、克霉唑、咪康唑、益康唑、联苯苄唑、酮康唑等。
抗深部真菌感染的药物有氟康唑、卡泊芬净、两性霉素B、制霉菌素、球红霉素、甲帕霉素、氟康唑、伊曲康唑、伏立康唑等。
需要根据具体的感染类型来规范的选择抗真菌药物。