怀孕3个月有褐色分泌物是不正常的，必须尽快到医院做B超检查和阴道检查。这时候有可能是先兆流产，胚胎停止发育或者是胎盘低置，也可能是宫颈炎症、宫颈的癌前病变，必须尽快明确原因以后进行治疗。如果是先兆流产，应该保胎治疗；如果是胎盘低置，一定要注意休息，密切观察出血的情况，一般情况下随着月份的长大，胎盘就会上升，流血就会停止；如果是宫颈炎症或者是宫颈的癌前病变，必须要根据检查的结果，确定下一步治疗，这时候可以做宫颈的癌前筛查。如果单纯的宫颈癌前病变是可以观察的，等到分娩以后42天，再次复查然后进行治疗。