桥本氏甲状腺炎，是自身免疫性甲状腺炎的一种，是常见的甲状腺疾病。目前尚无针对病因的治疗。桥本氏甲状腺炎的治疗指征主要是根据甲状腺功能状态和甲状腺肿的程度进行确定。
对没有明显临床症状、促甲状腺素水平正常，而且甲状腺肿不显著的患者，不需要药物治疗，可随诊观察。有局部压迫症状，影响美观的患者，可给予左旋甲状腺素治疗。已有促甲状腺素水平升高、临床有症状表现的患者，均给予甲状腺激素的替代治疗。
对于表现为甲状腺功能亢进的患者，合并格瑞斯病时，可以单纯给予受体阻断剂治疗，必要时可给予抗甲状腺药物治疗。对于甲状腺肿大明显，对邻近部位产生压迫的患者，可以用左旋甲状腺素治疗。
对于桥本氏甲状腺炎患者，一般不采取手术治疗，但是对于甲状腺肿大明显影响到美观，而且有压迫症状，怀疑有甲状腺癌的患者，可考虑手术治疗。在甲状腺呈现出亚急性炎症，甲状腺迅速肿大，伴有疼痛压迫症状时，可短期应用糖皮质激素，以较快地缓解症状，病情稳定后可以停药。