心源性晕厥是因为有心脏性疾病导致的晕厥发生，最常见的原因有慢性的心律失常，比如患者有病态窦房结综合征，或者是房室结传导阻滞等，在这种情况下可以使患者在短时间内出现心率过慢，如果静息下几率低于30次/分，则有引起晕厥的可能。另外患者可能在房颤转律之后，有比较长的间隙，如果精神状态下间歇大于三秒，也可能会导致心源性晕厥的发生。
另外，很多快速心律失常疾病，同样会导致心源性晕厥，最常见的有室性心动过速、心室颤动等，患者的血流动力学障碍，会引起血压的降低，导致心源性晕厥。还有快速的心律失常，比如阵发性室上性心动过速、快速房颤等，如果患者同时伴有缺血性脑血管疾病，也会引起心源性晕厥。