一旦确诊为斜视性弱视，应立即治疗，否则年龄超过视觉发育的敏感期，治疗将变得非常困难。斜视性弱视的疗效与治疗时机有关，发病越早，治疗越晚，疗效越差。治疗斜视性弱视的基本策略为消除形觉剥夺的原因、矫正在视觉上有意义的屈光不正和促进弱视眼的使用。
一、药物治疗
1、阿托品：阿托品是M受体阻滞剂，是一种长效散瞳剂，可以放大瞳孔、放松睫状肌。治疗斜视性弱视时在光学药物疗法中使用。
2、叶黄素：适当补充叶黄素，可增加视网膜内叶黄素含量，促进视力进一步发育。
二、手术治疗
针对引起斜视性弱视的病因，即斜视进行矫正手术治疗。
三、其他治疗
1、屈光矫正：精确配镜以矫正在视觉上有意义的屈光不正，可以提高屈光参差性弱视和斜视性弱视儿童的视力。高度屈光不正性弱视儿童在单独矫正屈光不正后，视力也获得了实质性提高。对单眼弱视，在消除病因和精确配镜的基础上促进弱视眼的使用才更有效。
2、遮盖治疗：常规遮盖治疗即遮盖优势眼，强迫弱视眼使用。用遮盖法治疗时，须密切观察被遮盖眼视力的变化，避免被遮盖眼发生遮盖性弱视。复诊时间根据患儿年龄确定，年龄越小，复诊间隔时间越短。1岁儿童复查间隔为1周，2岁儿童复查间隔为2周，4岁儿童复查间隔才能为1个月。因为弱视治疗易反复，双眼视力平衡后，要逐步减少遮盖时间慢慢停止遮盖治疗，维持治疗半年以上，以使疗效巩固。
3、光学药物疗法：即压抑疗法。适于中、低度单眼弱视及对遮盖治疗依从性不好的儿童。
（1）近距离压抑疗法：适用于最佳矫正视力≤0.3的儿童。优势眼每日滴1%阿托品散瞳，戴矫正眼镜，使优势眼只能看清远距离。弱视眼在矫正眼镜上再加+3.00D，使之无须调节便能看清近距离。
（2）远距离压抑法：适用于最佳矫正视力＞0.3的儿童。优势眼过矫+3.00D，使其只能看清近距离。弱视眼只戴最佳矫正眼镜，促进其视远。
4、其他：后像疗法、红色滤光片法、海丁格刷也是弱视治疗的有效方法，主要适用于旁中心注视者。视刺激疗法对中心凹注视、屈光不正性弱视效果较好，可作为遮盖疗法的辅助治疗，以缩短疗程。