松果体是大脑中重要的解剖结构，松果体的位置较深，且周围有重要的解剖结构，所以松果体的手术都是比较大的手术，当然松果体囊肿的手术也是如此。
事实上很多松果体囊肿患者没有任何临床表现，大部分患者都是体检偶然发现，所以大部分不需要治疗，定期复查即可。但是有少部分患者会产生临床症状，比较常见的症状包括头痛、眼球活动障碍等，有些患者会因为松果体囊肿堵塞脑脊液通路，而引起梗阻性脑积水，对于这类患者，就需要手术治疗，手术方式主要为开颅蛛网膜囊肿剥离术。从解剖上来看，松果体周围有脑干以及重要的引流静脉等解剖结构，因此手术相对较复杂，手术过程中要注意这些重要结构的保护，以防损伤。总的来说，如果松果体囊肿没有临床症状，则建议保守治疗。