紧急避孕药不会导致不孕不育，不孕不育常与服用避孕药是无关的。无论是短效口服避孕药还是紧急避孕药，对卵巢功能的影响常是比较小的，绝大多数人少量的服用紧急避孕药是不会引起不孕不育的。
因为卵巢功能减退可以有多种原因，包括精神的因素、机体、疾病、应激或者服药的因素，都可以导致卵巢功能出现异常。然而卵巢功能异常绝大多数与自身有关系，服药只是其当中很少的一部分。而多数的服药与避孕药关系不大，而多与化疗药、免疫抑制剂有关系。