子宫内膜异位症患者的主要表现包括痛经、不孕，性生活的时候会出现性交的不适。还有一些患者会出现月经的异常，比如月经量增多、经期延长、月经淋漓不尽。痛经比较常见，一般是继发性的痛经，而且痛经会进行性加重。另外，大概有40%-50%的患者会合并有不孕。还有其它部位出现的内膜异位症也相应的会出现症状，但是大概有25%左右的患者没有临床表现。
子宫内膜异位症是生育年龄女性比较常见的妇科疾病，根据异位内膜出现的部位，包括卵巢型的内膜异位症、腹膜型的内膜异位症、深部浸润性的内膜异位症，还有一些病人剖宫产的切口瘢痕也会形成瘢痕部位的内膜异位症。