口腔扁平苔癣的治疗方法，包括局部治疗、全身治疗或者应用中医、中药治疗。局部治疗是去除局部刺激因素，或者局部应用皮质激素，进行局部的封闭，对于比较轻的扁平苔癣有一定的效果。
如果是比较重的病人，需要局部治疗配合全身用药治疗，协同作用控制疾病的发展。除了局部治疗之外，全身治疗要皮质激素全身应用，或者选用氯喹等口服。如果怀疑有维生素缺乏，可以补充维生素A。
对于怀疑有白色念珠菌感染的，可以使用抗真菌的药物，全身治疗的副作用可能要大一些。另外可以考虑中医、中药的治疗，包括辨证施治综合的调节全身状态，增强身体的抵抗力。
腔扁平苔癣的治疗，并不能够明确的使口腔扁平苔癣完全恢复，都是一些对症性的治疗。