消化道肿瘤患者的生存时间，与肿瘤的原发部位、疾病分期，以及治疗方案密切相关。原发于食管、胃和肠道的肿瘤，预后要相对好于原发于肝脏、胆囊、胆管，以及胰腺的肿瘤。如果患者的分期偏早，属于1期、2期，可以接受根治性手术，切除原发肿瘤，术后生存时间是相对较长，5年生存率都会超过50%。如果患者确诊时已经是局部晚期，比如3期，该部分患者治疗效果相对要差，即使采取手术、化疗，以及放疗等综合治疗方案，5年生存率大概只有30%左右。如果患者在确诊时就已经发生远处转移，该部分患者的生存时间只有0.5-1年左右，采取化疗、靶向治疗，以及免疫治疗等综合治疗方案，可不同程度延长生存时间至2-3年左右，但患者的总体5年生存率是小于10%的。