肛瘘的治疗费用与患者病情、所在医院级别和当地经济发展水平有很大的关系。一般如果是单纯的肛瘘，以二级医院为例，费用大约在5000-6000元左右。而高位复杂性的肛瘘治疗费用会在这个基础上高出一两千元甚至数千元。因为高位复杂性肛瘘，手术创面大、手术难度较高、伤口深、恢复慢、住院的时间也更长，这些因素会直接影响治疗费用。建议到当地医院就诊，做好相关检查，如肛诊、内镜检查、B超检查、核共振检查等。再由专业医生根据检查结果明确肛瘘类型、病情，选择合适的治疗方法，必要时采取挂线疗法，可以有效的保护肛门功能，避免肛门失禁。