在男性应该做外生殖器及肛门部位的检查，尤其应该检查包皮内侧、龟头、冠状沟，或者尿道口有无疣状增生物，如果发现有鸡冠状、菜花状增生物，就可以诊断为尖锐湿疣。在男男同性恋患者应该检查肛门，尤其是肛管内是否有无尖锐湿疣。
在女性应该做内诊检查，外观检测看有无疣体，应该下窥器看宫颈、阴道壁是否有疣状增生，如果外阴和宫颈有疣状增生，就可以诊断为尖锐湿疣。