生殖器疱疹的症状主要是瘙痒，疼痛，簇集性疱疹。生殖器疱疹多在发疹前数小时到五天有局部搔痒的症状。生殖器疱疹患者的患病部位会出现集簇性的小水疱，很快破溃，形成糜烂或浅表溃疡，感觉有轻微的疼痛，瘙痒烧灼感。病变处见红斑，上有红疹，小水泡，脓疱，溃烂，溃疡，小裂口，腹股沟区淋巴结肿大，男性患者多发生在龟头，冠状沟，阴茎体，以及会阴等处。