引起小肠穿孔的原因有很多，例如回肠憩室发生穿孔、外伤导致穿孔，或者是自身免疫系统疾病导致穿孔。所以在发现穿孔后，需要积极完善相关检查，并行手术治疗。因为此时一般通过保守治疗无效，无法使肠穿孔自行愈合。医生会在开腹方式下，或者腹腔镜方法下，进行肠穿孔修补。
如果穿孔面积比较大，可能需要行肠道部分切除，之后再做肠道吻合。如果腹腔内炎症感染比较重，可能还需要行小肠造瘘。在术后3-6个月再次行肠道吻合，具体手术方式需要依据患者病情决定。在治疗期间患者需要遵医嘱调整饮食结构，不要自行吃药或吃饭。