睡觉长腰疼主要是见于腰椎本身，腰部的肌肉或者棘上韧带有一定炎症。在休息、睡觉过程当中，这些炎症累及、蓄积会导致腰疼，还有就是有些人因为睡觉的时候床垫太软，在睡觉的时候腰椎处在非生理曲线状态下，会导致后背的腰椎棘突、棘上韧带，还有椎旁的肌肉过度疲劳，容易导致出现棘上韧带的炎症、椎旁肌肉的炎症，甚至腰椎周围的软组织损伤，从而导致腰痛的发生。
有可能是因为睡觉时间长之后，局部腰部着凉或者不良刺激，也会导致腰痛的发生。有些老年人睡觉时间长腰疼，可能是因为本身的腰椎出现了骨质增生，或者增生比较严重，出现腰椎骨关节病，这种腰椎骨关节病长期保持一个姿势，可能会导致发生骨关节病的小关节出现僵硬，如果在变换姿势的时候，会导致小关节骨关节病引起腰痛，这是一方面的原因。有些老年人是因为腰椎间盘突出、腰椎管狭窄，保持一个姿势的时候有可能会导致神经根，或者脊髓局部神经根受压，神经受压引起局部腰疼。