输卵管堵塞主要由于各种病原体感染所导致，手术后损伤、粘连、子宫内膜异位症，以及先天发育异常，也会导致输卵管堵塞，病原体感染是引起输卵管堵塞的主要原因，常见的病原体包括淋病奈瑟菌、沙眼衣原体、支原体，还有就是吸氧菌，以及厌氧菌的感染。
感染的途径主要是沿生殖道黏膜上行蔓延，病原体侵入外阴阴道后，或阴道内本身存在的病原体沿宫颈黏膜子宫内膜蔓延至输卵管，这是非妊娠期、非产褥期的主要感染途径，出现输卵管堵塞的时候，如果有生育要求或者有症状，需要进行治疗。