肠瘘通常与手术、肠道疾病等有关，因此预防需积极治疗肠道疾病，避免更严重的后果。如需肠道手术，应选择经验丰富的医生进行治疗等。
（1）选择正规医院和有丰富经验的医生，可有效减少术后肠瘘的发生。
（2）膳食多样化，多吃新鲜蔬菜、水果，少吃辛辣刺激性食物，避免油炸和油脂高的食物，宜选择清淡饮食。
（3）对于患有糖尿病、肠道肿瘤的患者，需积极治疗原发病，以减少肠道并发症。