如果临床上明确诊断为滴虫性阴道炎，通常采用药物治疗的方式。目前推荐的是全身用药，并不推荐阴道内反复的洗液冲洗，以及不推荐单纯的阴道内用药。因为滴虫除了存在于患者的阴道内，可能还同时存在在尿道、前庭大腺等部位，所以单纯的阴道内用药效果不佳。通常全身用药，采取较多的是口服甲硝唑的方式进行治疗。甲硝唑可以采取单次2g口服，也可以采取400mg，每日2次，连服7天的方式进行治疗。或者采用替硝唑2g单次口服的方式进行治疗，通常患者的治愈率能达到90%以上。