乙肝小三阳在临床上导致的肝脏功能状态多种多样。绝大多数乙肝小三阳是肝功能持续保持正常、无任何临床症状、无需治疗的乙肝病毒携带者，小三阳携带者对于预期寿命几乎没有影响。乙肝小三阳如果导致肝脏炎症变化，肝细胞遭到乙肝病毒免疫介导的损害，而且这种反复的损害会导致肝纤维化和肝硬化，则会对患者的预期寿命有影响，但及时治疗则影响不大。如果乙肝小三阳导致肝硬化失代偿、肝衰竭或者肝癌的发生，则会影响非常大，例如肝硬化失代偿期患者，5年生存率仅为15%-35%。