甲状腺激素会影响到胆固醇的合成和分解，既可以促进肝脏合成胆固醇，又可以促进胆固醇及其代谢产物从胆汁中排泄。一般而言，血脂与甲状腺激素水平呈负相关，所谓的负相关就是甲状腺激素水平越高，血脂越低，相反甲状腺激素水平越低，则血脂会越高。
因为过多的甲状腺激素更有利于促进胆固醇的代谢，所以甲状腺功能亢进症患者在血脂大多数偏低。在甲状腺功能亢进症的治疗过程中，因为随着甲状腺功能亢进中的好转，代谢率由高转为正常，胆固醇的排泄也会随之降低，会出现血脂的增高现象。另外，要注意抗甲状腺药物对肝脏有一定的影响，血脂增高可以是肝功能减退所造成，这应该引起高度的重视。