阿莫西林常用于治疗敏感菌所致的中耳炎，咽炎，扁桃体炎，上呼吸道感染，急性支气管炎，泌尿生殖道感染，皮肤软质感染或者用于治疗急性单纯性淋病。也可以用于治疗伤寒，伤寒带菌者及钩端螺旋体病。它可以与克拉霉素，兰索拉唑三联用药以根除幽门螺杆菌，降低消化性溃疡的发生率。临床上还有一些少见的应用，比如用于治疗莱姆病，用于预防细菌性心内膜炎，以及用于预防炭疽热。成人口服给药1次0.5克，每六小时1次，1天剂量不超过4克。