1、肛门视诊：通常让患者取膝胸位或左侧卧位，观察肛门皮肤有无增厚、红肿、血性或脓性分泌物，以及观察有无皮疹及瘘管等肛门病变。
2、直肠指诊：直肠指诊是肛门直肠疾病检查方法中最简便有效的方法之一，患者通常取膝胸位，医生用手指在患者肛门内进行触摸。能对肛门皮肤做痛觉、触觉、温度觉测试，可辅助检查肛管腔有否狭窄及肛门括约肌的紧张度，检查是否有肿物及其大小质地等。
3、大小便常规检查：应做大小便、粪便常规检查，有助于排除尿路感染、急慢性肠炎、直肠肿瘤等疾病。
4、血液检查：常见的有血生化、血常规、凝血功能检查以及梅毒艾滋血清学检查，帮助患者判断是否合并性传播疾病以及身体情况是否适合行手术治疗。
5、肛门镜检查：通过镜检观察黏膜颜色，有无溃疡、出血、息肉、肿瘤及异物等，可清楚的看清痔的部位、大小、形态等，这是诊断痔疮的基本方法。