虽然对于绝大多数手足口病患儿，症状一般都不重。普通的患儿症状不重，即使不经过任何治疗，一个星期左右一般也能够痊愈。但有些手足口病患儿可以出现比较明显的症状，甚至可以出现并发症，导致危及生命。
所以手足口病的治疗效果，主要是控制并发症的出现，阻止危及生命的情况发生，同时控制比较危险的症状，让患儿平稳的度过手足口病的病程。手足口病的患儿可以出现明显的发热，应用退热的药物或者用其他方式控制体温，可以让患儿体温维持在一个比较合适的范围，不至于出现高热、惊厥等危险的情况。
手足口病患儿也有可能因为自身免疫力的下降，而出现神经系统的并发症，适当的应用糖皮质激素控制全身的炎症反应，必要时应用免疫球蛋白治疗，很可能让手足口病的重症不至于危及生命。