儿童心肌炎临床表现轻重不一，取决于年龄和感染的急性或慢性过程。预后大多良好，部分病人起病隐匿，有乏力、活动受限、心悸、胸痛的症状。少数重症病人可发生心力衰竭或严重心律紊乱、心源性休克，甚至猝死。少部分病人呈慢性进程，演变为扩张性的心肌病。
新生儿患病时病情进展快，常见于高热、反应低下、呼吸困难和子癫，常有神经、肝脏和肺部的并发症。体征是心脏有轻度的扩大，伴有心动过速、心音低钝以及奔马律，导致心力衰竭及晕厥等。反复心衰者心脏明显扩大，肺部出现湿性啰音、肝脾肿大、呼吸急促和子癫。重症患者可突然发生心源性休克、脉搏细数、血压下降，这是常见的症状和体征。
还要做相应的辅助检查，心电图、心脏的彩超。还有心肌血生化的指标、肌酸激酶、磷酸激酶的测定，还有血清乳酸脱氢酶、心肌肌钙蛋白的测定等一系列的检查是必须的。