甲状腺疾病有很多种，不同的甲状腺疾病病因是不同的。常见的甲状腺疾病有甲状腺功能亢进、甲状腺功能低下和甲状腺肿瘤。甲状腺功能亢进常见的病因是自身免疫性甲状腺病，和遗传、环境有关。环境中包括过度紧张、生活不规律、过多含碘食物的摄入都有可能诱发甲状腺功能亢进的发生。
甲状腺功能低下有可能是自身免疫性甲状腺炎导致的，也有可能是甲状腺手术或者碘-131治疗后导致的。甲状腺功能低下需要长期服用左甲状腺素激素替代治疗。甲状腺肿瘤的发病率也很高，甲状腺肿瘤发病原因到现在为止仍然不清楚。一部分甲状腺肿瘤有家族史，有过颈部放射治疗史的也容易患有甲状腺肿瘤。所以总体来说，不同的甲状腺疾病病因不同，需要具体的分析。