妊娠合并甲亢不主张甲状腺手术治疗，妊娠早期甲状腺手术容易引起流产，妊娠晚期甲状腺手术容易发生产科意外。手术应该选择妊娠16-24周进行，但因为风险比较大，妊娠期甲亢很少采用手术治疗。
如果孕妇对于抗甲状腺药物过敏，抗甲状腺药物疗效不佳或甲状腺明显的肿大，需要大剂量的抗甲状腺药物，才能控制甲亢时，可以考虑手术治疗。对于抗甲状腺药物过敏或治疗作用不敏感的人，手术以前可以用复方碘溶液，进行术前准备，建议妊娠期甲亢，应该使用抗甲状腺的药物治疗作为首选治疗。