补体在机体抵御致病微生物感染中起重要作用。某些情况下，病原微生物可借助补体受体入侵细胞，其机制为；
1、某些微生物与C3b、iC3b、C4b等补体片段结合，通过CR1、CR2而进入细胞，使感染播散。
2、某些微生物可以补体受体或补体调节蛋白作为其受体而入侵细胞，如EB病毒以CR2为受体麻疹病毒以MCP为受体；柯萨奇病毒和大肠埃希菌以DAF为受体。
3、某些微生物感染机体后，能产生一些与补体调节蛋白功能相似的蛋白抑制补体活化，从而逃避机体补体系统的攻击。