支气管源性囊肿出现症状以手术治疗为主，合并感染的患者需使用抗生素、化痰药等控制感染后，再行手术切除囊肿。
一、药物治疗
1、抗生素：对存在感染的患者需要进行抗生素治疗，治疗药品的选择需根据细菌培养和药敏试验结果来制定，常用药品如头孢哌酮钠舒巴坦钠。
2、化痰药：对于出现咳嗽咳痰的患者，为防止痰液阻塞气道，需要给予患者化痰药，常用药品为氨溴索，用以稀释痰液，易于排除。
二、手术治疗
支气管源性囊肿切除术，手术过程中必须将囊肿完全切除，囊壁遗留会引起复发，切除后本病可达到治愈。