肛门疼痛有疙瘩有可能是外痔或者肛裂引起的。炎性外痔和血栓性外痔都会引起肛门疼痛。炎性外痔一般水肿较厉害，皮色不变，多为胀痛；血栓性外痔一般为暗紫色或暗红色，触压痛明显，多为刺痛。肛裂会引起肛门剧烈疼痛，长期反复发作的陈旧性肛裂会有诸多并发症。哨兵痔就是一种典型的肛裂并发症，同样是肛门口隆起的小疙瘩，容易与外痔相混淆，用力牵拉肛门可以在哨兵痔的内侧看到肛裂的裂口，二者不难鉴别。