建议患者在湿疣治疗时，口服药只是辅助治疗，主要的治疗还是外用治疗，如外用咪喹莫特乳膏或者是鬼臼毒素软膏联合物理治疗。口服药可以给予增强免疫力的药物及抗病毒的药物，但是都不能单独应用，只能作为辅助用药，可以用增强免疫力的药物如转移因子，抗病毒的药物如泛昔洛韦、阿昔洛韦等，确切的疗效不是很肯定。
治疗尖锐湿疣通常都是外用药物联合物理治疗，物理治疗包括冷冻治疗、激光治疗、电凝治疗、电灼治疗、电离子治疗或者微波治疗等，这些物理治疗是通过直接的破坏作用来清除皮损。尖锐湿疣治疗的目的就是尽早的清除肉眼可见的疣体、改善可能有的症状、减少复发、改善精神压力、美观需求等。