扁平疣如果想要彻底的治好，需要根据以下几个方面进行调理：
第一、提高机体的免疫能力，可以选择在一段时间内肌注卡介菌多糖核酸钠注射液或者连续口服匹多莫德口服液、脾氨肽冻干粉、转移因子口服液等免疫调节药物，以提高机体的抗病能力，减少扁平疣发生的几率；
第二、要积极的治疗一些容易引起免疫力下降的原发性疾病，如恶性肿瘤或者糖尿病、高血脂、高血压等等；
第三、需要应用咪喹莫特软膏或者重组人干扰素α-2B软膏，混合维A酸软膏涂抹，加强对于本病的治疗，同时需要保证足疗程的治疗，避免中途停药，以免造成扁平疣的复发。