衣原体检测的临床意义主要是根据血清衣原体抗体的滴度以及不同的抗体的类型，对于临床判断是既往感染衣原体还是正在感染衣原体，是有一定的价值的。如果是既往感染，可以不做治疗，如果是现症感染需要及时的给予抗感染治疗。衣原体是很特殊的微生物，体积在细菌和病毒之间，而且培养需要特殊的培养基，才能够培养出来。
目前我们国家的绝大部分医院，临床检验科是不具备培养衣原体或者直接观察衣原体的条件的，所以可以利用血液或者人体免疫的抗原抗体反应，对间接的临床判断衣原体感染有一定的价值和意义。无非就是不同的免疫球蛋白阳性，比如IgG还是IgM的阳性，对于临床的判断意义又有不同。