胎粪吸入综合征是指新生儿吸入胎粪污染的羊水，从而引起呼吸系统的病理改变，主要发生在产前或者产时引起的吸入性肺炎。
主要的机制是胎儿由于宫内窘迫，导致胎儿的肛门括约肌松弛，胎粪排出，胎儿喘息呼吸，或者生后呼吸导致胎粪吸入，吸入之后引起气道机械性的阻塞，或者发生肺部化学性的炎症，导致的气体潴留，引起肺气漏或者肺通气不均匀，从而发生低氧血症和酸中毒，甚至会发生持续性肺动脉高压。有些也是因为继发性的肺泡表面活性物质不足，从而导致肺泡萎陷、肺内分流，也同样会发生低氧血症和酸中毒。