尖锐湿疣通常没有症状，少数患者会有异物感、疼痛、瘙痒、性交不适、恶臭、出血和明显的情感压抑。尿道内尖锐湿疣可以表现为终末血尿、尿流异常和尿道出血。
男性一般发生在龟头、冠状沟、包皮系带，尿道口、阴颈部和会阴，女性一般发生在大小阴唇、阴道口、阴蒂、阴道、宫颈、会阴及肛周，男性人群一般发生在肛门及直肠内，少数患者可以发生在肛门、生殖器以外的部位，例如口腔、腋窝、乳房和指缝等，目前对人乳头瘤病毒感染没有根治的办法。