先心病往往受到多种因素的影响而共同作用形成，主要包括遗传因素，以及妊娠期间的因素共同所导致。有先天性心脏病家族史的父母，其胎儿形成先天性心脏病的可能性，远远大于正常人。
对于妊娠期间出现的各种感染，如风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒等等，都可导致胎儿畸形的发生。婴儿在妊娠期间接触放射线，还有妊娠期间出现高血压，患者使用相关的药物，如肾素-血管紧张素系统抑制剂等等，都可造成胎儿畸形、先天性心脏病的发生。妊娠期间要注意监测心脏彩超的变化，必要时在妊娠期间可进行心脏的相关手术，纠正先天性心脏的畸形，必要时可提前终止妊娠。