非淋球菌性的尿道炎引起尿道疼痛，处理办法：
第一、口服双氯芬酸钠胶囊或者芬必得缓释胶囊等药物，缓解患者的疼痛症状。
第二、口服阿奇霉素、静脉输注阿奇霉素或者口服红霉素胶囊等药物，来治疗支原体、衣原体等非淋球菌性尿道炎的致病菌。根除相关的致病菌以后，尿道疼痛的症状也可逐渐缓解。
第三、保持每日超过2500mL以上的饮水量，除外可以加速药物的代谢，还可以产生较多的尿液来起到冲刷尿路，维持尿路清洁，缓解尿路炎性反应而减轻尿路疼痛的作用。
第四、也可以使用高锰酸钾溶液等来进行外生殖器局部的清洗，清除尿道内流出的黄色或者白色的分泌物，保持局部的清洁，防止这些炎性分泌物对尿道的刺激，减轻尿道内的疼痛感。