治疗抑郁症首选的药物，目前一线用药都是选择性5-羟色胺再摄取抑制剂，常用的药物有氟西汀、帕罗西汀、舍曲林、氟伏沙明、西酞普兰等五朵金花，也有西酞普兰的类似结构的药物艾司西酞普兰。
双通道的药物，比如度洛西汀、文拉法辛也可以作为首选药物。新型的抗抑郁药物，比如伏硫西汀、安非他酮、阿戈美拉汀也有非常良好的效果，副作用相对比较少，也可以作为治疗抑郁症的首选药物。
对于伴随自杀念头及行为的患者，也可以考虑合并心境稳定剂进行治疗，比如碳酸锂。对于失眠以及焦虑的患者也可以考虑合并苯二氮卓类的药物，比如劳拉西泮、奥沙西泮等等。
对于合并双相情感障碍的患者一定要考虑转躁的抗抑郁药物，比如服用安非他酮等等。具体的情况一定要具体分析，所以处方药最好听医嘱安排进行服药治疗。