当确定了是扁平苔藓以后，如何治疗主要要根据扁平苔藓是局部损害，还是全身非常广泛的损害，如果是局部损害仅仅是累及了局部的皮肤，直接外用激素类的软膏就可以了。
如果有黏膜部位的损伤，比如口腔黏膜或者是生殖器的黏膜有扁平苔藓，可以选择他克莫司的软膏，直接外用效果还是不错的，但是如果是全身非常广泛的扁平苔藓，最关键的是帮助病人去寻找到底是什么原因导致的。最常见的原因一个是药物的因素，还有没有感染的因素，尤其是一些病毒的感染，比如说肝炎病毒的感染，先要排除这些问题。如果已经排除了这些问题，可以用一些系统的治疗，比如口服羟基氯喹的治疗，甚至用系统的激素治疗。