腭裂的原因比较复杂，目前比较明确的病因是以下几种情况：第一、遗传因素，患儿的直系亲属如果有腭裂的情况，患儿患有腭裂就要比普通的孩子高出很多倍。第二，外界因素的影响，如果在胎儿的期间受到了外界的辐射刺激，或者母亲的情绪有其他的变化，都会导致在孕期胎儿出现基因的突变。第三、药物引起的突变，如果患儿的母亲在怀孕的期间吃了致畸的药物，也会引起孩子出现腭裂。如果是在备孕期间孩子的父亲有吸烟、饮酒或者吃了药物也容易引起孩子出现腭裂的可能。